簡(jiǎn)要描述:ingex 試劑盒 TGIRT™ KitIngex, LLC. 的總部,也是TGIRT™-III 獨(dú)立酶和TGIRT™ 模板轉(zhuǎn)換 RNA-seq 試劑盒.
產(chǎn)品分類(lèi)
Product Category詳細(xì)介紹
品牌 | 其他品牌 | 供貨周期 | 一個(gè)月 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),綜合 |
試劑盒里有什么:
試劑盒含量(10個(gè)反應(yīng)或25個(gè)反應(yīng)):
TGIRT® -III enzyme, 1 x 10 M l (KTGIRT-10) or 3 x 10 M l (KTGIRT-25)
10XPrimer混合物,50 M l (PM-110)
10 x DTT, 50 M l (D-121)
5x反應(yīng)緩沖區(qū),100 M l (RX-120)
TGIRT® -III enzyme ,a RNA和DNA寡核苷酸的混合 (可退火 形成含有R2RNA/R2R異型基因的 第一個(gè)適配器序列 , dithiothreitol (DTT) ,以及 反應(yīng)緩沖區(qū) 去執(zhí)行 ® 照明rnan及sdnaa-seq分析的模板轉(zhuǎn)換應(yīng)。 這個(gè)工具包能夠與第一個(gè)rna-后續(xù)適配器無(wú)縫連接到cDNA的5'端,合成rna模板的cDNA副本。為香港及香港的 DNA寡核苷酸 (單獨(dú)購(gòu)買(mǎi)) 第二組子適配器序列 必須加到CDNA的3'端 5'微生物/RNA連接酶 (新英格蘭生物學(xué)家;M019或M0319L)在PCR擴(kuò)增之前。
可以做什么實(shí)驗(yàn)?
1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。8
2.全細(xì)胞、胞外體、血漿和其他無(wú)細(xì)胞RNA的RNA序列7,8,15
3.miRNA、tRNA和其他非編碼小RNA的分析1-9,12,15
4.RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP和CRAC用于表征RNA-蛋白質(zhì)相互作用和核糖體圖譜。1,10,115
5.通過(guò)高通量測(cè)序鑒定RNA堿基修飾。4,5,13,14
6.單鏈DNA-序列16
7.FFPE腫瘤樣本分析(咨詢(xún)InGex技術(shù)支持)。
以下是您應(yīng)該使用TGIRT的原因:
比逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)能力和保真度,允許從高度結(jié)構(gòu)化和/或高度修飾的RNAs(例如tRNAs)和含有富含GC重復(fù)擴(kuò)增的RNAs進(jìn)行全長(zhǎng)、端到端的cDNA合成。1-9,12,15,17
新的端到端模板轉(zhuǎn)換活性,能夠在逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中連接RNA-seq或PCR接頭,并且不需要單獨(dú)的拖尾或RNA 3’-接頭連接步驟。1與使用隨機(jī)六聚體引物或使用RNA連接酶進(jìn)行接頭連接的程序相比,這種模板轉(zhuǎn)換活性極大地促進(jìn)了鏈特異性RNA-seq文庫(kù)的構(gòu)建,偏差更小。1,7,8
能夠從低至2 ng的RNA輸入中產(chǎn)生全面的圖譜。7,15
從RNA模板到PCR產(chǎn)物的RNA-seq文庫(kù)構(gòu)建需要不到5小時(shí)。7,8,15
TGIRT更適合通過(guò)tgi rt-模板轉(zhuǎn)換構(gòu)建RNA-seq文庫(kù):
1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。
去核糖的片段化通用人類(lèi)參考RNA樣品的TGIRT -seq概括了人類(lèi)轉(zhuǎn)錄物和刺突蛋白的相對(duì)豐度,與非鏈特異性TruSeq v2相當(dāng),且優(yōu)于鏈特異性Tru-Seq v3。TGIRT -seq比TruSeq v3具有更強(qiáng)的鏈特異性,并消除了TruSeq固有的隨機(jī)六聚體引發(fā)的取樣偏差。與TruSeq相比,TGIRT -seq顯示了更均勻的5’至3’基因覆蓋范圍,并識(shí)別了更多的剪接點(diǎn)。TGIRT -seq能夠在相同的RNA-seq中同時(shí)分析mrna和lncRNAs,作為結(jié)構(gòu)化的小ncRNAs,包括trna,它們基本上不存在于TruSeq數(shù)據(jù)集。8
2.人類(lèi)全細(xì)胞、胞外體、血漿和其他細(xì)胞外RNA序列。
快速處理時(shí)間(通過(guò)PCR步驟構(gòu)建RNA-seq文庫(kù)< 5小時(shí));需要少量RNA(低ng范圍);全面的轉(zhuǎn)錄譜,包括mRNAs和lncRNAs以及小ncrna,包括tRNAs、前miRNAs和其他結(jié)構(gòu)化小ncrna的全長(zhǎng)閱讀;不需要RNA連接酶;與常規(guī)方法相比,偏差更小,效率更高,鏈特異性更強(qiáng)。7,8,15
3.高度結(jié)構(gòu)化和/或高度修飾的RNA模板的RNA-seq。
更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)加工性和鏈置換使得獲得tRNAs和其他結(jié)構(gòu)化/修飾的小ncRNAs的全長(zhǎng)、端到端cDNAs成為可能,這些小ncRNAs對(duì)逆轉(zhuǎn)錄病毒RTs.4-9,12-15是不可抵抗的。
4.在諸如RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP、CRAC、核糖體分析等方法中通過(guò)TGIRT模板轉(zhuǎn)換構(gòu)建RNA-seq文庫(kù)。
快速處理時(shí)間(通過(guò)PCR步驟構(gòu)建RNA-seq文庫(kù)< 5小時(shí));需要少量RNA(低ng范圍);不需要RNA連接酶,操作步驟更少,偏差更小,效率更高。1,10,11
5.人血漿和大腸桿菌基因組DNA的ssDNA序列。
通過(guò)直接在DNA鏈的3’端啟動(dòng)DNA合成,同時(shí)連接DNA-seq銜接子,無(wú)需末端修復(fù)、加尾或連接,以更簡(jiǎn)單的工作流程捕獲精確的DNA末端。能夠分析核小體定位、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、DNA甲基化位點(diǎn)和來(lái)源組織。
上海牧榮生物科技有限公司
國(guó)內(nèi)試劑耗材經(jīng)銷(xiāo)代理。
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質(zhì)量保證,所有產(chǎn)品都提供售后服務(wù)。付款方式靈活。公司堅(jiān)持“一站式"服務(wù)模式,為客戶(hù)全面解決實(shí)驗(yàn)、生產(chǎn)、開(kāi)發(fā)需求。公司整合國(guó)際與國(guó)內(nèi)資源,加強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)建設(shè),提高公司內(nèi)部運(yùn)作效率,為客戶(hù)提供方便、快捷的服務(wù)。
公司突出創(chuàng)新思維,提高工作效能,減低運(yùn)作成本,為客戶(hù)提供優(yōu)惠的價(jià)格。
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