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肽是怎么合成的?

更新時間:2024-08-06      點擊次數(shù):542

在有機化學中,肽合成是肽的產生,肽是其中多個氨基酸通過肽鍵(也稱為酰胺鍵)結合的有機化合物。

內容

 

1.化學
2.液相合成
3.固相合成
3.1.中國銀行SPPS
3.2.Fmoc SPPS
4.固體支持物
4.1.聚苯乙烯樹脂
4.2.聚酰胺樹脂
5.保護團體
5.1.Fmoc保護基團
5.2.Boc保護基團
5.3.芐氧羰基(Z)基團
5.4.Alloc保護基團
5.5.平版保護基團
6.激活組
6.1.碳化二亞胺
6.2.芳香肟
7.合成長肽
8.固相肽合成的一個例子
9.參考

1.化學

 

肽是通過將一個氨基酸的羧基或C端偶聯(lián)到另一個氨基酸的氨基或N端而合成的。

2.液相合成

 

液相肽合成是肽合成的經典方法。在大多數(shù)實驗室中,它已被固相合成所取代(見下文)。然而,它在用于工業(yè)目的的肽的大規(guī)模生產中仍然有用。

3.固相合成

 

Merrifield固相肽合成(SPPS)導致了肽合成領域的范式轉變。這是目前實驗室以合成方式制造肽和蛋白質的方法。SPPS允許合成難以在細菌中表達的天然肽、摻入非天然氨基酸、肽/蛋白質骨架修飾以及合成由D-氨基酸組成的D-蛋白質。


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                       固相肽合成(SPPS)原理

小珠子用接頭處理,在接頭上可以構建肽鏈。合成珠將保持與肽的強結合,直到被試劑裂解。珠子創(chuàng)造了一種合成環(huán)境,在這種環(huán)境中,產生的肽鏈不會通過過濾材料,而用于產生肽鏈的試劑會通過。

 

重點考慮在每一步中產生高的產量。例如,如果每個步驟具有99%的產率,26個氨基酸的肽將以77%的最終產率合成,如果每個步驟是95%,它將以25%的產率合成。因此,每一種氨基酸都是以大大過量(2 ~ 10倍)添加的,并且通過一系列充分表征的試劑將氨基酸偶聯(lián)在一起是高度優(yōu)化的

 

有兩種主要的SPPS形式——Fmoc和Boc。與核糖體蛋白質合成不同,固相肽合成以C-末端到N-末端的方式進行。氨基酸單體的N-末端被這兩個基團保護,并被加到去保護的氨基酸鏈上。

 

自動合成器可用于這兩種技術,盡管許多研究小組繼續(xù)手動執(zhí)行spp。

 

SPPS受到產量的限制,通常70~100個氨基酸范圍內的肽和蛋白質正在推動合成可及性的極限。合成難度也依賴于序列;典型的淀粉樣肽和蛋白質很難制造。通過使用天然化學連接將兩個肽偶聯(lián)在一起,可以獲得更長的長度,并具有定量的產量。

3.1.中國銀行SPPS

 

當R. B. Merrifield在1963年發(fā)明SPPS時,它是根據(jù)tBoc方法。t-Boc(或Boc)代表叔丁氧羰基。為了從生長的肽鏈上去除Boc,使用酸性條件(通常是純TFA)。在合成結束時,通過在氫氟酸中孵育(這可能是危險的),從樹脂中除去側鏈保護基團和肽;由于這個原因,Boc化學通常不受歡迎。然而,對于復雜的合成,Boc是有利的。當合成對堿基敏感的非天然肽類似物(如depsi肽)時,Boc是必需的。

3.2.Fmoc SPPS

 

4.固體支持物                        

 

固相支持物的物理性質及其可用于的應用,隨著構建支持物的材料、交聯(lián)的量以及所用的接頭和手柄而變化。

4.1.聚苯乙烯樹脂

 

這是一種多功能樹脂,由于其在DCM中的溶脹最小,因此在多孔自動化肽合成中非常有用。

4.2.聚酰胺樹脂

 

這也是一種有用和多用途的樹脂。它似乎比聚苯乙烯膨脹得多,在這種情況下,如果孔太小,它可能不適合一些自動合成器。

5.保護團體

 

由于在每個合成步驟中使用過量的氨基酸來確保偶聯(lián),在每個氨基酸未被保護的反應中,氨基酸的聚合是常見的。為了防止這種聚合,使用了保護基團。這給合成反應增加了額外的去保護階段,產生了如下的重復設計流程:

 

• 在去保護反應中,保護基團從尾部氨基酸中被除去

• 洗去脫保護試劑以提供清潔的偶聯(lián)環(huán)境

• 溶解在溶劑如二甲基甲酰胺(DMF)中的受保護的氨基酸與偶聯(lián)劑混合,泵送通過合成柱

• 洗去偶聯(lián)試劑以提供干凈的去保護環(huán)境

 

目前,固相肽合成中通常使用兩種保護基團(Fmoc,Boc)。它們的不穩(wěn)定性是由氨基甲酸酯基團引起的,氨基甲酸酯基團容易釋放CO2用于不可逆的解偶聯(lián)步驟。

5.1.Fmoc保護基團

 

Fmoc(9-芴基甲基氨基甲酸酯)是目前廣泛使用的保護基團,其通常在從氨基酸單元重復合成肽的過程中從肽的N末端除去。Fmoc的優(yōu)點是它在非常溫和的堿性條件下(例如哌啶)被裂解,但在酸性條件下穩(wěn)定。這使得在堿性條件下穩(wěn)定的溫和的酸不穩(wěn)定保護基團,例如Boc和芐基,被用于目標肽的氨基酸殘基的側鏈上。這種正交保護基策略在有機合成領域很常見。

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5.2.Boc保護基團

 

在Fmoc基團流行之前,Boc基團通常用于保護肽的末端胺,需要在正交策略中使用更多酸穩(wěn)定的基團用于側鏈保護。它保留了在合成過程中減少肽聚集的作用。Boc基團可以用boc酸酐和合適的堿加成到氨基酸上。

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5.3.芐氧羰基(Z)基團

 

另一種基于氨基甲酸酯的基團是芐氧羰基(Z)基團。它在更苛刻的條件下被去除:溴化氫/乙酸或催化氫化。今天,它幾乎用于側鏈保護。

5.4.Alloc保護基團

 

當需要鄰位去保護方案時,烯丙氧基羰基(alloc)保護基團通常用于保護羧酸、羥基或氨基。有時在進行樹脂上環(huán)肽形成時使用,其中肽通過側鏈官能團與樹脂連接??梢允褂盟?三苯基膦)鈀(0)以及氯仿、乙酸和N-甲基嗎啉(NMM)的37∶2∶1混合物2小時來除去alloc基團。然后,必須用0.5 % DIPEA的DMF溶液、3×10ml 0.5%二乙基硫代氨基甲酸鈉的DMF溶液以及5×10ml 1:1 DCM:DMF溶液仔細清洗樹脂。

5.5.平版保護基團

 

對于特殊應用,如蛋白質微陣列,使用平版印刷保護基團。這些基團可以通過曝光去除。

6.激活組

 

為了偶聯(lián)肽,羧基通常被活化。這對加速反應很重要。有兩種主要類型的活化基團:碳二亞胺和芳香肟。

6.1.碳化二亞胺

 

這些活化劑最初是被開發(fā)出來的。最常見的是二環(huán)己基碳二亞胺(DCC)和二異丙基碳二亞胺(DIC)。與羧酸反應生成高活性的O-?;濉T谌斯さ鞍踪|合成過程中(如Fmoc固態(tài)合成儀),C末端通常用作氨基酸單體添加的附著位點。為了增強羧酸基團的親電性,帶負電荷的氧必須首先被“活化"成更好的離去基團。DCC用于此目的。帶負電荷的氧將充當親核試劑,攻擊DCC中的中心碳。DCC暫時連接到以前的羧酸酯基團(現(xiàn)在是酯基團),使得氨基(在連接的氨基酸上)對以前的C-末端(碳?;?的親核攻擊更有效。碳二亞胺的問題是它們反應性太強,因此會導致氨基酸的外消旋化。

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6.2.芳香肟

 

為了解決外消旋化的問題,引入了芳香肟。最重要的是1-羥基-苯并三唑(HOBt)和1-羥基-7-氮雜-苯并三唑(HOAt)。


image.png

其他的已經開發(fā)出來了。這些物質可以與O-酰基脲反應生成活性酯,該活性酯的活性較低,外消旋化的危險也較小。由于鄰群效應,HOAt特別有利。[1]


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最新的發(fā)展省略了碳二亞胺。活性酯作為非親核陰離子(四氟硼酸鹽或六氟磷酸鹽)的脲鹽或鏻鹽引入:HBTU、HATU、PyBOP。

7.合成長肽

 

逐步延伸,其中氨基酸逐步依次連接,對于含有2至100個氨基酸殘基的小肽是理想的。另一種方法是片段縮合,其中肽片段被偶聯(lián)。雖然前者可以延長肽鏈而不發(fā)生外消旋化,但如果僅用于產生長肽或高極性肽,產量會下降。對于合成復雜的長肽來說,片段縮合比逐步延伸更好,但是為了防止外消旋化,必須限制它的使用。片段縮合也是不希望的,因為偶聯(lián)的片段必須大大過量,這可能是一個取決于片段長度的限制。

 

產生更長肽鏈的一個新進展是化學連接:未保護的肽鏈在水溶液中發(fā)生化學選擇性反應。第一個動力學控制的產物重排形成酰胺鍵。最常見的天然化學連接形式使用與末端半胱氨酸殘基反應的肽硫酯。

8.固相肽合成的一個例子

 

以下是使用堿不穩(wěn)定的9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)保護基團在聚酰胺或聚苯乙烯樹脂上合成肽的合成步驟的概述。使用下面概述的技術,將獲得在N-末端用乙?;舛耍贑-末端用伯酰胺(CONH2)封端的肽。

 

為手動肽合成設置玻璃器皿

 

手動肽合成可以在具有三通閥的燒結過濾器反應容器中完成,該三通閥通過1孔塞子安裝在1 L側臂真空燒瓶上。一個閥門用于充入氮氣,氮氣首先通過一個小的Drierite柱,然后進入反應混合物以攪拌溶液和混合試劑。另一個閥門用于排空過量的反應溶液,并使用真空瓶洗滌溶劑。用于固相合成的所有玻璃片應在使用前用硅烷化試劑(如DCM中的1-5%二甲基二氯硅烷)處理,以避免靜電荷的積累,靜電荷的積累會使樹脂很難處理。

 

聚酰胺樹脂的制備

 

聚酰胺(PL-DMA)樹脂(1g)用乙二胺(40 ml)在50 ml Falcon管中在搖床上處理過夜,然后過濾,用5×10ml 1:1二甲基甲酰胺(DMF):二氯甲烷(DCM)溶液、5×10ml 1:1 DCM洗滌,并使用苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷六氟磷酸鹽(PyBOP) (3 eq)、1-羥基苯并三唑水合物(HOBt) (3 eq)和二異丙基乙胺(DIPEA)裝載Fmoc-Rink然后可以在真空下干燥,并儲存在-15攝氏度,直到需要。

 

在合成前和合成過程中處理樹脂

 

樹脂首先在10毫升1∶1 DCM∶DMF中溶脹15分鐘,然后瀝干。每次完成氨基酸偶聯(lián)后,還用5×10ml 1:1 DCM和DMF洗滌樹脂。

 

Fmoc-去保護

每次氨基酸偶聯(lián)后,用2×10ml 20%哌啶的DMF溶液進行Fmoc去保護,每次處理用N2攪拌10分鐘。然后用5×10毫升DMF洗滌樹脂,接著用5×10毫升1:1 DCM:DMF洗滌。

 

添加氨基酸

 

為了在Fmoc-聚酰胺-Rink樹脂上開始肽合成,通過用哌啶處理樹脂來除去Fmoc基團。然后使用在1∶1 DCM∶DMF中的PyBOP (3 eq)、HOBt (3 eq)和DIPEA (6 eq)將第一個氨基酸偶聯(lián)至樹脂的Fmoc-去保護的N-末端胺,或之前偶聯(lián)的氨基酸,直到樹脂對茚三酮呈陰性。

 

監(jiān)測氨基酸偶聯(lián)的進展

 

氨基酸偶聯(lián)的過程可以用茚三酮或對氯醌來跟蹤。茚三酮溶液在游離伯胺的存在下變成深藍色(陽性結果),但在其他情況下是無色的(陰性結果)。如果使用乙醛作為溶劑,在伯胺的存在下,或者如果使用丙酮,在仲胺的存在下,對-氯醌溶液將使樹脂珠變成深黑色或藍色;否則珠子保持無色或淡黃色。(測試概述如下)

 

茚三酮測試(1)

 

向微量離心管中加入2滴40%苯酚的乙醇溶液、2滴0.014 M KCN的吡啶溶液和4滴5%茚三酮的乙醇溶液,以及抹刀一端大小的樹脂樣品,然后渦旋混合物,并在100°c下加熱5分鐘

 

用氯醌測試(2)

 

向微量離心管中加入5滴丙酮或乙醛、5滴對氯醌的甲苯飽和溶液,以及小刮刀一端大小的樹脂樣品,然后渦旋混合物,并在室溫下靜置5分鐘。丙酮用于檢測仲胺,乙醛用于檢測伯胺。

 

持續(xù)肽延伸

 

一旦氨基酸的偶聯(lián)完成,就洗滌樹脂,用哌啶去保護Fmoc基團,并再次洗滌樹脂,為下一次偶聯(lián)做準備。重復這一過程,直到添加完所有必需的氨基酸。

 

乙酰化N-末端

 

肽序列完成后,可以用2ml 1:1乙酸酐和三乙胺在10ml 1:1 DCM:DMF中乙?;疦-末端胺1小時或直到茚三酮陰性,然后用5×10ml 1:1 DCM:DMF洗滌樹脂,然后將肽從樹脂上切下。如果需要,N-末端也可以作為游離胺留下。

 

從樹脂上切割肽

 

用3×10ml 96∶2∶2的TFA、三異丙基硅烷(TIPS)和水(H2O)處理樹脂,每次處理10分鐘,然后過濾掉樹脂,將合并的濾液靜置1小時,以確保除去酸不穩(wěn)定的保護基團。

 

從樹脂上切割后肽的處理

 

將TFA在旋轉蒸發(fā)器上蒸發(fā)至干(或重油或玻璃,如果它不凝固的話),隨后向燒瓶中加入5 ml*醚以沉淀肽,并除去大部分副產物。將肽和乙*的懸浮混合物加入到50 ml Falcon管中,并以3000 rpm的速度旋轉10-20分鐘(IEC離心機),直到可以倒出乙*而不損失任何肽。加入更多的后,通過渦旋使肽重新懸浮。再次離心混合物,倒出,洗滌過程重復兩次以上。最后,產品可以在脫粘器中的Falcon管中風干過夜。

通常使用制備型HPLC來純化最終產物。獲得質譜數(shù)據(jù)以確保獲得目標肽。



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