DNA 凈化,也稱為磁珠凈化,是指從樣品混合物中定向去除小 DNA 片段,例如引物、接頭和二聚體,用于下游 PCR、DNA 連接/克隆或 DNA 文庫等。
有時,有些人所說的DNA凈化可能指的是去除DNA提取過程中實際涉及的其他物質(zhì),例如鹽、蛋白質(zhì)和酶等。我們可以稱之為預(yù)清理。
因此,現(xiàn)在通過DNA凈化,我們特別關(guān)注引物、接頭以及由引物或接頭形成的二聚體,因為它們也是由DNA寡核苷酸形成的。也就是說它們也是DNA片段。當這些碎片在樣品中以高比例存在時。它們可能會導(dǎo)致各種問題并干擾 NGS 儀器上的正確測序,例如它們可能會占用大量測序容量并導(dǎo)致觸發(fā)許多 QC 指標。它們可能會導(dǎo)致 NGS 對齊錯誤和增加未對齊讀取,從而損害數(shù)據(jù)質(zhì)量。
有效的 DNA 凈化可以提高 PCR 和測序效率、改進數(shù)據(jù),甚至可以對低輸入樣品進行測序,并節(jié)省資金。
NVIGEN 磁性納米顆粒可實現(xiàn) DNA 產(chǎn)品的 DNA 凈化。它們可用于 PCR 產(chǎn)物凈化、NGS(下一代測序)文庫構(gòu)建、終止子染料去除以及從測定樣品(例如細胞裂解物)中去除其他污染物。